随着时代发展，人们对动物疾病诊治的要求越来越高，传统的只用眼看、听诊器听、体温表查、叩诊锤打这些诊断方式已不能满足兽医临床需要。
超声能够在一定程度上克服局限性，更加精确、灵敏地检测动物状况，及时发现细微病变，对临床诊断、治疗策略的确定以及长期监测病情具有一定的指导意义。
消化系统疾病
胃、肠道疾病
消化系统的疾病是常发病，也是较难定性发病部位的一类疾病。应用超声诊断技术可以准确定性异物阻塞、肠套叠、胃肠肿瘤等疾病。
异物阻塞：反射和吸收使声束衰减的物体则产生声影，胃肠内看见这种声影，有益于胃肠内异物的确定，任超声图所看见的近物体表面的回声反射，常是物体形状的特征性反映。
肠套叠：声像图上多表现为多耙样病变，并伴有邻近部位液体蓄积和肠蠕动减弱，有的肠套叠超声图像呈现复合或同心环特征，肠套叠前段显示无回声暗区，证明有积液。
胃肠肿瘤：胃平滑肌瘤呈现较大的回声图，若中央有一不规则的似火山口样的强回声则提示肿瘤有深的溃疡，淋巴肉瘤为孤立的回形质回声。
炎症性疾病
伴有溃疡的胃炎病犬，其特征性影像是广泛性胃壁增厚。在胃窦增厚区域内有火山口样的强回声，其余部位胃壁变化不明显。
肝脾疾病
超声可用于检查肝外胆汁郁积和胆管炎；检查肝、胆囊、严重的胆汁郁积、肝内胆管、胆囊管、胆囊严重膨胀；测定肝脏的大小、血管直径和位置。
肝脏作为全身最大的消化器官，它也是最易发病的器官之一。肝脏疾病的超声诊断可表现为肿大、萎缩、回声增强或减弱、局部回声的改变等一系列变化。超声诊断旰脓肿疾病，根据肝脓肿的数量、大小、形状、回声、位置来确定其病理特征。同时发现，单个脓肿比多个脓肿常见且直径要大。超声区别诊断的优点在对肝脓肿、肿瘤、脂肪肝、肝硬化的诊断上表现尤为明显，其诊断的准确率较高，超声诊断技术可特异性地诊断肝脏血管疾病。
胆囊类疾病常见的有胆囊炎、胆结石及胆管的完全或不完全性的阻塞。超声对诊断胆结石，可以确定结石在胆囊内还是在胆管内。因为胆囊内的结石可表现在液性暗区一边有极强回声团块，而胆管结石胆囊一般会增大。超声对区别诊断脾破裂、血肿、扭转、变位等疾病快速准确。
泌尿系统疾病
泌尿器官结石
肾结石、膀胱结石、尿道结石等大多是由于核心物上沉积矿物质，凝结成较为致密的结石团块或泥砂，它与周围组织或液体形成阻抗差异极大的超声界面，在超声切面声像图中形成回声特强的光团或光斑，且往往带有声影，在探查时只要部位准确，不难确认。
强回声光团、声影、结石可随病畜体位改变发生位移是诊断结石病的三大特征。
膀胱结石：膀胱壁呈光滑而均匀的回声结构，囊内尿液呈无回声的暗区，可诊断出回声极强的结石块，结石回声较明亮而细窄，呈带状，伴有明显声影，用探头压迫膀胱或改变动物的保定姿势，结石块可发生位置的改变。
肾结石：在肾内有极强的回声且在后方伴有声影回声图谱。
脓肿：脓肿壁回声增强、界限清晰、囊内回声减弱或无回声结构。
泌尿器官积水囊肿肿瘤、炎症
肾脏肾盂积水、肾囊肿、肾肿瘤及急慢性肾炎。根据超声诊断得出的肾体积变化、肾盂回声情况可判断是否为肾盂肾炎、输尿管阻塞、膀胱积尿(超声检查时有轮廓清晰的大面积液性暗区)、肾肿瘤等。肾脓肿表现出特异的回声图谱。膀胱作为贮存和排空尿液的器官，其体积变化幅度较大，所以它在超声图上可表现为体积的可变性。膀胱常见的疾病有膀胱上皮癌和肿瘤。
超声诊断技术也适用于指导冲洗尿道。
生殖系统疾病
产科疾病
超声诊断技术可及时准确地发现产科疾病。
常见产科疾病有子宫积液、子宫蓄脓、化脓性子宫内膜炎、卵巢囊肿、子宫积瘤、难产、流产及死胎，子宫、乳腺、睾丸的肿瘤，以及前列腺肥大与肿瘤等，均可通过超声作出确诊或鉴别诊断，并针对病变组织的位置、大小、性状等作进一步测量分析。
炎症时,子宫腔轮廓模糊不清、宫腔膨胀，且伴有回声及雪片状物；积脓时，子宫体增大，宫壁清晰，宫腔内有液性暗区。
分娩情况监测
妊娠诊断、怀胎数目、预测胎龄及胎儿活力等的诊断。
早孕诊断主要是以探测到孕囊或孕体作为依据。孕囊是子宫内的圆形液性暗区(GS),孕体为GS内的强回声光团或光斑。
根据胎心搏动和胚胎结构可鉴死胎、气肿胎、判断胚胎吸收和流产。
根据产中、产后子宫内部结构监护分娩，判断分娩是否结束，监测子宫产后复旧状况等。
心脏疾病
由于超声成像的空间分辨率和穿透深度成反比，因此可利用显微超声技术的高空间分辨率来观察小动物的心血管系统，监测心脏的运动、心室壁厚度、瓣膜的活动以及血流速度等一系列反应心脏功能的指标。
心脏超声检查技术由于其具有方便、快捷、非侵入性、无放射性、可动态观察、实时诊断等优点，已成为小动物心脏疾病的常规诊断手段。
通过心脏超声检查技术可观察到心脏内部结构、瓣膜运动、心脏内血流情况以及周围大血管情况，可用于疾病的诊断及先天性心脏病的筛查等。对心包积液、瓣膜闭锁不全等疾病，心脏超声在无损伤的情况下即可作出正确的诊断。此外超声对诊断其它方面疾病表现出特有的优越性。脑部疾病一般有供血不足、肿瘤及神经根压迫等，所有的这些都可以在超声图上表现出来。
